Qué provoca el covid persistente es todavía una incógnita. Hay hipótesis que apuntan a una disfunción inmunológica, a una respuesta inflamatoria que se mantiene o a la producción de autoanticuerpos. También a la posibilidad de que el virus siga presente en el cuerpo de estos pacientes. En este sentido un estudio realizado por investigadores del servicio de microbiología clínica del Hospital General Universitario Gregorio Marañón, ha observado que en una parte de los pacientes infectados por SARS-CoV-2, que mantienen una sintomatología inespecífica varias semanas después, tienen presente en su organismo el ARN del virus porque han logrado detectarlo a través de la sangre, la orina o las heces.
Un 45 por ciento de estos pacientes presentaban determinaciones positivas de ARN de SARS-CoV-2 en plasma más de cuatro semanas después del diagnóstico y algo más del 50 por ciento de los pacientes presentaban PCR positiva en al menos una muestra extrarrespiratoria, aunque los investigadores no lograron realizar una secuenciación genética completa de las muestras debido a la baja carga viral de las mismas y tampoco pudieron llevar a cabo cultivos para ver si esos virus serían viables o no.